活細胞轉(zhuǎn)錄組測序；45000個植物公共RNA-seq文庫在線搜索平臺

快報摘要 - Wrap Up

科 技 突 破

Science Breakthrough

NAR ：基于大片段knockin的高效基因編輯器TEd #基因編輯#

NBT
：高保真Cas13蛋白變體加速RNA編輯工具應(yīng)用 #基因編輯#

FASE專輯：農(nóng)業(yè)基因組編輯：技術(shù)、應(yīng)用與調(diào)控 #基因編輯#

JIPB：開發(fā)植物轉(zhuǎn)基因成分CRISPR/Cas12a高效快檢技術(shù) #基因檢測#

Nature：活細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)首次實現(xiàn)測序后細胞存活 #基因測序#

ACS
：脂質(zhì)工程促進釀酒酵母中蝦青素增產(chǎn)靶 #合成生物#

Nat Microbiol：基于豆科植物控制固氮菌多肽能與血紅素結(jié)合的治療應(yīng)用 #微生物#

JSB ：首個BR信號途徑BES1/BZR1類型β-amylase蛋白三維晶體結(jié)構(gòu) #AI設(shè)計#

PBJ ：45000個植物公共RNA-seq文庫在線搜索平臺 #生物計算#

科 技 突 破

NAR：基于大片段knockin的高效基因編輯器TEd 基因編輯

哺乳類動物細胞中對于長片段DNA的精準插入效率非常低，嚴重阻礙了CRISRP技術(shù)在大片段基因編輯時的操作可行性
。上?？萍即髮W(xué)高冠軍團隊報道了一種簡單 、高效的基因編輯方法—TEd 。該研究通過在傳統(tǒng)HR-donor上引入轉(zhuǎn)錄過程以改變DNA修復(fù)過程中的供體染色質(zhì)結(jié)構(gòu)狀態(tài)來促進同源重組的發(fā)生 ，從而實現(xiàn)細胞內(nèi)大片段DNA的高效編輯 。TEd初步解決了傳統(tǒng)CRISPR-Cas9介導(dǎo)的同源重組在大片段knockin效率低的問題 。此外，該方法對于基因刪除 、取代  、點突變較傳統(tǒng)方法都有顯著提高。

原文鏈接 ：

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkac676/6656067

NBT：高保真Cas13蛋白變體加速RNA編輯工具應(yīng)用 基因編輯

CRISPR-Cas13系統(tǒng)已被用于各種生物體中的靶向 RNA降解 ，但周圍的任意RNA的旁切效應(yīng)限制了它們在體內(nèi)的應(yīng)用。輝大基因/中國科學(xué)院神經(jīng)研究所團隊研究設(shè)計了一個雙熒光報告系統(tǒng)，用于檢測哺乳動物細胞中的旁切效應(yīng)和篩選Cas13變體。通過誘變減少或消除混雜的RNA結(jié)合，該研究獲得了幾種用于靶向RNA降解的高保真Cas13變體，具有最小的旁切效應(yīng) ，可用于基礎(chǔ)研究和治療應(yīng)用中的RNA靶向降解。

原文鏈接
：

https://www.nature.com/articles/s41587-022-01419-7

FASE專輯：農(nóng)業(yè)基因組編輯：技術(shù)、應(yīng)用與調(diào)控 基因編輯

基因編輯技術(shù)在農(nóng)業(yè)綠色可持續(xù)發(fā)展過程中起著極為重要的作用?！掇r(nóng)業(yè)科學(xué)與工程前沿》（FASE）特邀中國農(nóng)業(yè)大學(xué)趙要風教授、吳森教授 、及中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所高彩霞教授為組稿人，在2020年度第二期專輯——“農(nóng)業(yè)基因組編輯：技術(shù)  、應(yīng)用與調(diào)控”中詳細介紹基因編輯技術(shù)的發(fā)展現(xiàn)狀、在農(nóng)業(yè)家畜及植物中的應(yīng)用，并重點介紹了美國、巴西和中國對基因編輯技術(shù)的政策調(diào)控。

JIPB：開發(fā)植物轉(zhuǎn)基因成分CRISPR/Cas12a高效快檢技術(shù) 基因檢測

隨著全球轉(zhuǎn)基因作物種植面積的不斷增加